神父不应该有任何越轨行为，但神父的同性恋倾向可以从很多地方看出（美甲、拒绝与同桌分享一本书的恐同威廉·伦敦、不止一次厌恶的眼神、干花书签、不明前科），他也知道黑人学生是同性恋（黑人母亲曾明确表示这是他的本性，神父后来得知黑人学生被父亲家暴，与他有默契）他的母亲），但是神父和学生之间的友谊，也就是修女们口中的温暖感觉，难道是因为长辈对晚辈的特殊照顾和喜爱吗？还是为了同一批边缘群体（性少数、黑人）取暖？还是潜意识里夹杂着同性之爱？对于这一点，神父心中充满了疑惑，他已经无法辨别这些情绪的来源，这也是他辞职的原因。《怀疑》这个标题一语三义，除了这件事是罗生门和修女们心中自我怀疑和爆炸的一例外，在神父们的心中也同样存在着怀疑。

如果说干花标本代表了神父心中隐藏的仁慈和人性，那么影片中的很多细节则表明修女是一个对宗教没有那么忠诚的世俗人士。

1。每次讲道结束后，修女都会做出敷衍的十字手势和不耐烦的表情（与周围的人相比）。

2。和詹姆斯修女一样，她不介意教室上方挂着已故教皇的错误照片。她只是利用照片玻璃罩的反光来检查学生的课堂行为。对她来说，宗教只是权力的工具，她更关心的是世俗世界和秩序。

3。这一点在修女与黑人母亲的对话中表现得更加明显。当黑人母亲坦白儿子的同性恋（天性）时，作为母亲，她期望得到修女的理解和同情，但修女却说：我只对行动感兴趣。修女并不关心她的学生是否是同性恋，或者是否违反教义，她只是想知道学生和神父之间是否有什么行为，并以此来打倒神父，甚至威胁要开除那位学生（当然，从她对年老尼姑的关心和照顾就可以看出，尼姑并不是那么恶毒的人）。当她得不到自己想到的答案时，她的脸上写满了失望。

人心如沼泽。探索得越深，就会陷得越深，疑惑就会越多。因此，试图窥探别人内心的秘密是非常危险的。这是一个无底洞。