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为了配合NDS版（钻石与珍珠版）的推出，TV动画同步推出了新系列《神奇宝贝钻石&珍珠》（神奇宝贝钻石&珍珠，先行区之战结束后，小遥告别小智，独自挑战成都地区的华丽较量。小胜回到成华体育馆，小刚也回家了。在小茂的启发下，小智带着皮卡丘和走私的长尾怪物只身前往神奥地区挑战联盟。新女主角小光是根据电子游戏的NDS版本改编的。为了成为顶级协调训练师。