幽灵窃取技术改进了超光速。在迈克尔的帮助下，人类捕获了大量的幽灵，并抢劫了一艘蜂巢级战舰。不幸的是，鬼魂逃走了，并吸引了另外几艘蜂巢级战舰，随后战舰在战斗中被炸毁。然后遇到了古人创造的克隆人，被吉乃人科尔亚和谢帕德抓到的鬼魂逃走了，鬼魂被谢帕德丢了性命，而科尔亚则在随后的骗子打酱油合集中被杀。麦凯恩和同样才华横溢的妹妹打酱油，顺便用掉了ZPM。一艘古代宇宙飞船是代达罗斯在以0.9999光速飞行时发现的。其中大约有100名古人想要返回亚特兰蒂斯并驱逐SGU。然而克隆人却发起进攻，占领了亚特兰蒂斯，消灭了古人。6人小队赶回来消灭克隆人，并获得了古人飞船带来的3个ZPM。遗憾的是，星门中心仍然只给了亚特兰蒂斯1个，拿走了另外2个。麦凯恩在亚特兰蒂斯寻宝时，被古人飞升实验室改造为飞升模式，但老麦无法提升他的精神，只能等死。顺便说一下，在飞升模式的bug全开的情况下，他改进了代达罗斯的超光引擎，节省了亚特兰蒂斯的体力。创建了数学分支，并撰写了500页的韦尔博士传记。他治愈了被电流刺穿的卡兰，并听到了其他人的想法。他用意念移动物体等等，可惜取消飞升模式后，麦凯看不懂自己写的东西。方程的。韦尔度假，泰勒怀孕，卡特接替麦凯尔，泰勒怀孕，星门链计划被幽灵发现，幽灵入侵地球星门指挥中心，幸好他们被两个猛男蒂尔克和罗南分开。几分钟之内就完成了。迈克尔对哈芬人发明的病毒进行了升级，并随机传播到一些星球。该病毒可以杀死30%的人类，而幸存者不能被鬼魂吸走，如果鬼魂被吸走，就会感染病毒而死亡。托德和亚特兰蒂斯达成协议并共同解决。。。绝望的迈克尔利用一只大甲虫和人类DNA创造了一名超级士兵。远征地球的复制人舰队被地球新旗舰阿波罗号的突然袭击摧毁。复制人向亚特兰蒂斯发起报复，但亚特兰蒂斯虽然飞离了星球，但已经几乎筋疲力尽。ZPM的能量在星际荒野中崩溃了。。。我没看出卡森有什么问题。这很奇怪。是不是被砍掉了？这一季的主线剧情比较多，有些事情让人莫名其妙。比如卡特取代了威尔，泰勒生下了孩子，而泰勒是如何被救出来的却没有任何解释。是不是缺了一集？