白子成功渡过地表入侵、山地基因危机、阿里智力危机、天空辐射危机5年后，以小oHeda为首的天人和地表人回到了地面。

在重建家园时，他们意外发现美国国防部在二战前建立的海底智能基地因备用电源终止而浮出水面。

探索后发现基地内无人生还。

修复好供电设备后，天人进入了潜艇基地的控制系统。原来，这是冷战时期开发的太空战基地。之所以建在海底，是为了安全和保密。

海底基地可以访问仍在运行的军用卫星。意外发现美国秘密接触宇宙中的神圣文明。神圣文明的外交舰队一百年前就出发了，如今已经进入了银河系边缘。

神级文明发现地球文明已不复存在。

与此同时，阿里在空间站的备份系统误判了神圣文明的目的，希望他们能够帮助人类重建家园。

然而，神圣文明已经开始了殖民地球的计划。

外交舰队的使命是消灭地球上残存的文明，建立新的秩序。

天空人和地表人将如何利用地球落后的文明打败宇宙诸神，将是本季的看点。

基本剧情设定，神级文明也是碳基生物，外形与人类相似，武器也是基于量子力学研发，但比人类的科技胜利更加先进。那时的人类。

神族文明与地球文明发现对方后，他们认为地球文明的技术是爆炸性的，他们到达地球后可能无法保持技术领先。但出于对未知世界的好奇，他们派出了两艘星舰和一万人。由星灵战士组成的外交舰队。